Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LOXL3P58215 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LOXL3P58215 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms