Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPAP53621 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPAP53621 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPAP53621 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPAP53621 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPAP53621 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPAP53621 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPAP53621 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPAP53621 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPAP53621 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms