Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 SRB8YCR081W 4284 nt2.66□□□□□ -1.98
UFD1P53044 RRP42YDL111C 798 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CLB3YDL155W 1284 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MET14YKL001C 609 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SFH1YLR321C 1281 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MTL1YGR023W 1656 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ARG2YJL071W 1725 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 AEP2YMR282C 1743 nt2.65□□□□□ -1.99
UFD1P53044 KIN82YCR091W 2163 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SEC15YGL233W 2733 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR131CYDR131C 1671 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YHR202WYHR202W 1809 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 WHI3YNL197C 1986 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 BUD26YDR241W 288 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 BMT5YIL096C 1011 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YJL175WYJL175W 513 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 FYV6YNL133C 522 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PEX11YOL147C 711 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MSM1YGR171C 1728 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ITC1YGL133W 3795 nt2.64□□□□□ -1.99
UFD1P53044 VPS17YOR132W 1656 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 UBP14YBR058C 2346 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SPH1YLR313C 1593 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 FLO11YIR019C 4104 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DTD1YDL219W 453 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PNC1YGL037C 651 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 TDA10YGR205W 873 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MPC3YGR243W 441 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DOG1YHR044C 741 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 HTD2YHR067W 843 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 AIM23YJL131C 1071 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 BOS1YLR078C 735 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CTP1YBR291C 900 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ADY4YLR227C 1482 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 VAS1YGR094W 3315 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SAP1YER047C 2694 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PMR1YGL167C 2853 nt2.63□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SEC7YDR170C 6030 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YML096WYML096W 1578 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 ECM29YHL030W 5607 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 GCD6YDR211W 2139 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MRPL32YCR003W 552 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PET100YDR079W 336 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YHR180WYHR180W 492 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YIL161WYIL161W 708 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SNX4YJL036W 1272 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CSM3YMR048W 954 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 UFE1YOR075W 1041 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 NFT1YKR103W 3657 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DUF1YOL087C 3351 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SKT5YBL061C 2091 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SEC27YGL137W 2670 nt2.62□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PIN4YBL051C 2007 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 POL3YDL102W 3294 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR193WYDR193W 399 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR209CYDR209C 414 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RPL1BYGL135W 654 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RPL27AYHR010W 411 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YHR097CYHR097C 1101 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SWD2YKL018W 990 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SDH3YKL141W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YML094C-AYML094C-A 402 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CDC5YMR001C 2118 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RAS1YOR101W 930 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 TUM1YOR251C 915 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YPL107WYPL107W 747 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 AFT2YPL202C 1251 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RPL1AYPL220W 654 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DIM1YPL266W 957 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CCL1YPR025C 1182 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 STE23YLR389C 3084 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 PAM1YDR251W 2493 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CDC55YGL190C 1581 nt2.61□□□□□ -1.99
UFD1P53044 RGC1YPR115W 3252 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YGR237CYGR237C 2358 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DSF2YBR007C 2211 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 CHS3YBR023C 3498 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 GIC2YDR309C 1152 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 TCA17YEL048C 459 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 THP2YHR167W 786 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 SDP1YIL113W 630 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 DAL2YIR029W 1032 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 AIM25YJR100C 984 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YAR069CYAR069C 294 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 FMP41YNL168C 780 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 MCT1YOR221C 1083 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 snR44snR44 211 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 EPL1YFL024C 2499 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YER138CYER138C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
UFD1P53044 YER160CYER160C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms