Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP5P51878 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP5P51878 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP5P51878 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP5P51878 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP5P51878 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP5P51878 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP5P51878 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP5P51878 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CASP5P51878 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP5P51878 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP5P51878 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP5P51878 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms