Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFBP49765 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFBP49765 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms