Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRPC1P48995 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRPC1P48995 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms