Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCLCP48506 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCLCP48506 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCLCP48506 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCLCP48506 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLCP48506 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLCP48506 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms