Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP5P45974 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP5P45974 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP5P45974 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP5P45974 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP5P45974 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP5P45974 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP5P45974 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms