Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTTP42858 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTTP42858 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTTP42858 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HTTP42858 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTTP42858 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTTP42858 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HTTP42858 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HTTP42858 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HTTP42858 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HTTP42858 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms