Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMPOP42166 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMPOP42166 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMPOP42166 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMPOP42166 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMPOP42166 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms