Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELK3P41970 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELK3P41970 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELK3P41970 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELK3P41970 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELK3P41970 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELK3P41970 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms