Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 FYV12YOR183W 390 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 PZF1YPR186C 1290 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 ARP5YNL059C 2268 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 MMS1YPR164W 4224 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YHP1YDR451C 1062 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YKL131WYKL131W 522 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 MRPL38YKL170W 417 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 ARF3YOR094W 552 nt2.68□□□□□ -1.98
PDR11P40550 OCT1YKL134C 2319 nt2.67□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YJL147CYJL147C 1149 nt2.67□□□□□ -1.98
PDR11P40550 IST1YNL265C 897 nt2.67□□□□□ -1.98
PDR11P40550 CPR8YNR028W 927 nt2.67□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YGR226CYGR226C 210 nt2.66□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt2.66□□□□□ -1.98
PDR11P40550 ATG29YPL166W 642 nt2.66□□□□□ -1.98
PDR11P40550 SEC16YPL085W 6588 nt2.66□□□□□ -1.98
PDR11P40550 MGR3YMR115W 1506 nt2.66□□□□□ -1.98
PDR11P40550 YJL016WYJL016W 1686 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YDR089WYDR089W 2610 nt2.65□□□□□ -1.99
PDR11P40550 JSN1YJR091C 3276 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 STF2YGR008C 255 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YGR073CYGR073C 372 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YHI9YHR029C 885 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 LSM1YJL124C 519 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 NUP192YJL039C 5052 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 SMC2YFR031C 3513 nt2.64□□□□□ -1.99
PDR11P40550 TFC1YBR123C 1950 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 ADH4YGL256W 1149 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 SYM1YLR251W 594 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 ALG1YBR110W 1350 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 KAR5YMR065W 1515 nt2.63□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YNL193WYNL193W 1677 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 RBK1YCR036W 1002 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 TIF35YDR429C 825 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YKR051WYKR051W 1257 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 HDA2YDR295C 2025 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 LYS9YNR050C 1341 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 SXM1YDR395W 2835 nt2.62□□□□□ -1.99
PDR11P40550 NAT1YDL040C 2565 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YHL037CYHL037C 402 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR230WYLR230W 306 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 RNA1YMR235C 1224 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 AIM39YOL053W 1188 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 TOM1YDR457W 9807 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 LAP2YNL045W 2016 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 GSH2YOL049W 1476 nt2.61□□□□□ -1.99
PDR11P40550 ADI1YMR009W 540 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 HAT1YPL001W 1125 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 STH1YIL126W 4080 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 VHR2YER064C 1518 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 NFI1YOR156C 2181 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 PIP2YOR363C 2991 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 TOP1YOL006C 2310 nt2.6□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YCR013CYCR013C 648 nt2.59□□□□□ -1.99
PDR11P40550 PEX10YDR265W 1014 nt2.59□□□□□ -1.99
PDR11P40550 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
PDR11P40550 RPL27BYDR471W 411 nt2.59□□□□□ -2
PDR11P40550 YNR071CYNR071C 1029 nt2.59□□□□□ -2
PDR11P40550 SBE22YHR103W 2559 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 FAB1YFR019W 6837 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 KOG1YHR186C 4674 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 YER085CYER085C 522 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 YGL101WYGL101W 648 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 REV7YIL139C 738 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 PCD1YLR151C 1023 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 BTS1YPL069C 1008 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 YPR203WYPR203W 309 nt2.58□□□□□ -2
PDR11P40550 YDR131CYDR131C 1671 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 SCH9YHR205W 2475 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 YDR209CYDR209C 414 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 IZH1YDR492W 951 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 YLR365WYLR365W 333 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 RUF21RUF21 707 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 ATP3YBR039W 936 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 GPB1YOR371C 2694 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 CDC24YAL041W 2565 nt2.57□□□□□ -2
PDR11P40550 YKL075CYKL075C 1353 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 ALE1YOR175C 1860 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 YAL065CYAL065C 387 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 YMR141CYMR141C 309 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 TRM3YDL112W 4311 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 LCB4YOR171C 1875 nt2.56□□□□□ -2
PDR11P40550 TEC1YBR083W 1461 nt2.55□□□□□ -2
PDR11P40550 YHL045WYHL045W 348 nt2.55□□□□□ -2
PDR11P40550 YNL228WYNL228W 777 nt2.55□□□□□ -2
PDR11P40550 PEX11YOL147C 711 nt2.55□□□□□ -2
PDR11P40550 SAD1YFR005C 1347 nt2.55□□□□□ -2
PDR11P40550 VMA22YHR060W 546 nt2.54□□□□□ -2
PDR11P40550 YHR210CYHR210C 1026 nt2.54□□□□□ -2
PDR11P40550 SSU72YNL222W 621 nt2.54□□□□□ -2
PDR11P40550 YOR333CYOR333C 417 nt2.54□□□□□ -2
PDR11P40550 BNI4YNL233W 2679 nt2.54□□□□□ -2
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