Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIK1P39086 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK1P39086 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms