Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LTBRP36941 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LTBRP36941 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LTBRP36941 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LTBRP36941 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LTBRP36941 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LTBRP36941 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LTBRP36941 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms