Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2H1P32780 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2H1P32780 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms