Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HLA-FP30511 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-FP30511 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms