Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabra2P26048 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms