Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATF3P18847 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATF3P18847 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATF3P18847 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATF3P18847 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATF3P18847 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATF3P18847 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms