Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB4P17483 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms