Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC130P13994 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC130P13994 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms