Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BMP3P12645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BMP3P12645 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BMP3P12645 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BMP3P12645 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP3P12645 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP3P12645 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BMP3P12645 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BMP3P12645 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BMP3P12645 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BMP3P12645 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BMP3P12645 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
BMP3P12645 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BMP3P12645 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BMP3P12645 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms