Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GLI4P10075 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GLI4P10075 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GLI4P10075 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GLI4P10075 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GLI4P10075 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GLI4P10075 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GLI4P10075 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GLI4P10075 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GLI4P10075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms