Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RGPD2P0DJD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RGPD2P0DJD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms