Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PKHD1P08F94 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PKHD1P08F94 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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