Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRAP08240 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRPRAP08240 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms