Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRPA1O75762 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPA1O75762 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms