Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BNIP3LO60238 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BNIP3LO60238 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms