Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTATSF1O43719 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTATSF1O43719 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HTATSF1O43719 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTATSF1O43719 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HTATSF1O43719 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms