Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC7A4O43246 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms