Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMD3O43242 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms