Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNMO15061 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNMO15061 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNMO15061 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNMO15061 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNMO15061 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNMO15061 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNMO15061 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNMO15061 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNMO15061 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNMO15061 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNMO15061 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms