Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IKBKBO14920 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IKBKBO14920 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms