Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms