Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC69A6NI79 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC69A6NI79 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms