Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEMP2A6NFY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NEMP2A6NFY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms