Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XIRP2A4UGR9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XIRP2A4UGR9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms