Protein–RNA interactions for Protein: R4GN34

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GN34 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
R4GN34 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
R4GN34 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
R4GN34 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
R4GN34 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms