Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms