Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNMT3LQ9UJW3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNMT3LQ9UJW3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms