Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP68Q9UHB9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP68Q9UHB9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms