Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC4Q9UBN4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRPC4Q9UBN4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms