Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCMF1Q9P0J7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms