Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCKIPSDQ9NZQ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms