Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms