Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RHBDL2Q9NX52 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHBDL2Q9NX52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms