Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNAJC17Q9NVM6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNAJC17Q9NVM6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms