Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFRSF19Q9NS68 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFRSF19Q9NS68 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms