Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH3GLB2Q9NR46 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH3GLB2Q9NR46 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms