Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGRNQ9NPE2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms