Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNRC6CQ9HCJ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNRC6CQ9HCJ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms